Nella Regione Puglia le aree SNAI per il ciclo 2021-2027 sono complessivamente 5 di cui 4 sono le aree della programmazione 2014-2020:
- Area Interna Alta Murgia
- Area Interna Gargano
- Area Interna Sud Salento
- Area Interna Monti Dauni
A queste si aggiunge 1 nuova area Alto Salento quale nuova area interna per il ciclo di programmazione 2021-2027.