L’organo di governo della Strategia è lo Steering Committee, cui l’Italia partecipa con un rappresentante del Ministero degli esteri e della cooperazione internazionale e un rappresentante del Dipartimento per le politiche di coesione. WestMED beneficia di un Meccanismo di assistenza tecnica finanziato dalla Commissione europea, con un nucleo centrale a Bruxelles e National Hub dedicati. Il Meccanismo ha il compito specifico di creare un network tra gli stakeholders, i centri di ricerca, le autorità locali e le amministrazioni centrali, con lo scopo di facilitare l’adozione di progetti comuni finanziabili dalle varie fonti disponibili a livello UE e internazionale.